REMARK SPARTA+ Protein Chemical Shift Prediction Table REMARK REMARK All chemical shifts are reported in ppm: REMARK REMARK SS_SHIFT is the predicted secondary chemical shift. REMARK SHIFT is the predicted chemical shift. REMARK RC_SHIFT is the random coil chemical shift. REMARK HM_SHIFT is the ring current shift; a correction REMARK of 0.6 times this value is applied. REMARK EF_SHIFT is the adjustment for electric field effect, REMARK applied to proton shifts only. REMARK SIGMA is the estimated prediction error. REMARK REMARK Reference: REMARK Y. Shen and A. Bax: SPARTA+: a modest improvement in empirical NMR REMARK chemical shift prediction by means of an artificial neural network. REMARK J. Biomol. NMR 48, 13-22 (2010). DATA SOURCE 3abd_1_A DATA FIRST_RESID 12 DATA SEQUENCE GQVVADVLCE FLEVAVHLIL YVREVYPVGI FQKRKKYNVP VQMSCHPELN DATA SEQUENCE QYIQDTLHCV KPLLEKNDVE KVVVVILDKE HRPVEKFVFE ITQPPXXXXX DATA SEQUENCE XDSLLSHVEQ LLAAFILKIS VCDAVLDHNP PGCTFTVLVH TRXXXXXXXX DATA SEQUENCE XXXXXXDFPW ILADEQDVHM HDPRLIPLKT MTSDILKMQL YVEERAHKGS VARS RESID RESNAME ATOMNAME SS_SHIFT SHIFT RC_SHIFT HM_SHIFT EF_SHIFT SIGMA FORMAT %4d %4s %4s %9.3f %9.3f %9.3f %9.3f %9.3f %9.3f 12 G HA2 0.000 nan 3.960 nan 0.000 0.244 12 G HA3 0.000 4.022 3.960 0.103 0.000 0.244 12 G C 0.000 174.890 174.900 -0.016 0.000 0.946 12 G CA 0.000 45.091 45.100 -0.015 0.000 0.502 13 Q N 0.691 120.482 119.800 -0.015 0.000 2.123 13 Q HA 0.004 4.406 4.340 0.103 0.000 0.199 13 Q C 2.795 178.790 176.000 -0.008 0.000 0.966 13 Q CA 2.100 57.895 55.803 -0.014 0.000 0.845 13 Q CB -0.047 28.683 28.738 -0.013 0.000 0.907 13 Q HN 0.549 nan 8.270 nan 0.000 0.439 14 V N -2.347 117.562 119.914 -0.007 0.000 2.295 14 V HA -0.186 3.995 4.120 0.103 0.000 0.246 14 V C 2.164 178.257 176.094 -0.001 0.000 1.049 14 V CA 1.470 63.768 62.300 -0.003 0.000 1.024 14 V CB -1.076 30.744 31.823 -0.005 0.000 0.648 14 V HN 0.088 nan 8.190 nan 0.000 0.447 15 V N 1.202 121.111 119.914 -0.008 0.000 2.343 15 V HA -0.179 4.002 4.120 0.103 0.000 0.247 15 V C 3.119 179.209 176.094 -0.006 0.000 1.051 15 V CA 2.245 64.538 62.300 -0.012 0.000 1.036 15 V CB -1.373 30.440 31.823 -0.017 0.000 0.654 15 V HN 0.644 nan 8.190 nan 0.000 0.451 16 A N -0.235 122.580 122.820 -0.007 0.000 1.933 16 A HA -0.251 4.131 4.320 0.103 0.000 0.218 16 A C 1.993 179.582 177.584 0.008 0.000 1.175 16 A CA 2.093 54.126 52.037 -0.007 0.000 0.628 16 A CB -0.528 18.460 19.000 -0.020 0.000 0.814 16 A HN 0.555 nan 8.150 nan 0.000 0.444 17 D N -0.451 119.957 120.400 0.012 0.000 2.120 17 D HA -0.057 4.645 4.640 0.103 0.000 0.202 17 D C 2.153 178.481 176.300 0.047 0.000 0.972 17 D CA 1.322 55.337 54.000 0.026 0.000 0.837 17 D CB -0.484 40.328 40.800 0.020 0.000 0.989 17 D HN 0.188 nan 8.370 nan 0.000 0.469 18 V N 1.333 121.274 119.914 0.045 0.000 2.287 18 V HA -0.220 3.962 4.120 0.103 0.000 0.248 18 V C 2.668 178.826 176.094 0.105 0.000 1.053 18 V CA 1.237 63.581 62.300 0.074 0.000 1.027 18 V CB -0.436 31.412 31.823 0.040 0.000 0.646 18 V HN 0.204 nan 8.190 nan 0.000 0.447 19 L N -1.136 120.124 121.223 0.063 0.000 2.093 19 L HA -0.190 4.212 4.340 0.103 0.000 0.208 19 L C 2.582 179.521 176.870 0.114 0.000 1.085 19 L CA 1.471 56.363 54.840 0.088 0.000 0.755 19 L CB -0.460 41.617 42.059 0.030 0.000 0.904 19 L HN 0.421 nan 8.230 nan 0.000 0.435 20 C N -0.450 118.892 119.300 0.070 0.000 2.446 20 C HA -0.170 4.351 4.460 0.103 0.000 0.277 20 C C 2.711 177.743 174.990 0.070 0.000 1.275 20 C CA 0.906 59.957 59.018 0.055 0.000 1.727 20 C CB -0.578 27.189 27.740 0.046 0.000 2.010 20 C HN 0.539 nan 8.230 nan 0.000 0.486 21 E N -0.099 120.160 120.200 0.099 0.000 2.077 21 E HA -0.238 4.174 4.350 0.103 0.000 0.193 21 E C 1.916 178.633 176.600 0.194 0.000 0.989 21 E CA 1.267 57.735 56.400 0.113 0.000 0.800 21 E CB -0.272 29.493 29.700 0.109 0.000 0.746 21 E HN 0.647 nan 8.360 nan 0.000 0.452 22 F N 1.235 121.247 119.950 0.104 0.000 2.113 22 F HA -0.121 4.472 4.527 0.110 0.000 0.297 22 F C 1.859 177.641 175.800 -0.031 0.000 1.103 22 F CA 1.241 59.293 58.000 0.088 0.000 1.248 22 F CB -0.264 38.705 39.000 -0.051 0.000 0.999 22 F HN -0.004 nan 8.300 nan 0.000 0.475 23 L N 0.220 121.296 121.223 -0.246 0.000 2.127 23 L HA -0.219 4.183 4.340 0.103 0.000 0.211 23 L C 2.541 179.252 176.870 -0.264 0.000 1.089 23 L CA 1.859 56.441 54.840 -0.431 0.000 0.757 23 L CB -0.740 41.171 42.059 -0.247 0.000 0.899 23 L HN 0.323 nan 8.230 nan 0.000 0.434 24 E N 0.004 120.144 120.200 -0.100 0.000 2.028 24 E HA -0.183 4.228 4.350 0.103 0.000 0.191 24 E C 2.240 178.867 176.600 0.044 0.000 0.988 24 E CA 1.387 57.797 56.400 0.017 0.000 0.799 24 E CB 0.136 29.860 29.700 0.041 0.000 0.755 24 E HN 0.225 nan 8.360 nan 0.000 0.447 25 V N 1.412 121.302 119.914 -0.039 0.000 2.332 25 V HA -0.291 3.891 4.120 0.103 0.000 0.248 25 V C 2.480 178.535 176.094 -0.064 0.000 1.055 25 V CA 1.919 64.202 62.300 -0.028 0.000 1.038 25 V CB -0.832 31.029 31.823 0.063 0.000 0.651 25 V HN 0.456 nan 8.190 nan 0.000 0.450 26 A N -0.413 122.236 122.820 -0.285 0.000 1.902 26 A HA -0.151 4.231 4.320 0.103 0.000 0.217 26 A C 2.398 179.902 177.584 -0.132 0.000 1.181 26 A CA 2.016 53.890 52.037 -0.272 0.000 0.623 26 A CB -0.647 18.017 19.000 -0.559 0.000 0.818 26 A HN 0.335 nan 8.150 nan 0.000 0.443 27 V N -0.273 119.562 119.914 -0.132 0.000 2.295 27 V HA -0.276 3.905 4.120 0.103 0.000 0.246 27 V C 2.404 178.431 176.094 -0.113 0.000 1.049 27 V CA 2.092 64.320 62.300 -0.121 0.000 1.024 27 V CB -1.077 30.697 31.823 -0.082 0.000 0.648 27 V HN 0.655 nan 8.190 nan 0.000 0.447 28 H N -0.923 118.109 119.070 -0.063 0.000 2.319 28 H HA -0.208 4.417 4.556 0.115 0.000 0.297 28 H C 2.264 177.616 175.328 0.040 0.000 1.097 28 H CA 2.256 58.337 56.048 0.055 0.000 1.285 28 H CB -0.127 29.683 29.762 0.080 0.000 1.368 28 H HN 0.293 nan 8.280 nan 0.000 0.495 29 L N 1.063 122.339 121.223 0.090 0.000 2.093 29 L HA -0.109 4.292 4.340 0.103 0.000 0.208 29 L C 2.365 179.199 176.870 -0.059 0.000 1.085 29 L CA 1.155 56.002 54.840 0.011 0.000 0.755 29 L CB -0.659 41.406 42.059 0.011 0.000 0.904 29 L HN 0.159 nan 8.230 nan 0.000 0.435 30 I N -1.079 119.394 120.570 -0.161 0.000 2.179 30 I HA -0.346 3.886 4.170 0.103 0.000 0.242 30 I C 2.343 178.301 176.117 -0.266 0.000 1.088 30 I CA 1.383 62.470 61.300 -0.354 0.000 1.357 30 I CB -0.327 37.313 38.000 -0.600 0.000 1.051 30 I HN 0.240 nan 8.210 nan 0.000 0.409 31 L N -0.643 120.462 121.223 -0.197 0.000 2.079 31 L HA -0.269 4.133 4.340 0.103 0.000 0.210 31 L C 2.669 179.491 176.870 -0.080 0.000 1.081 31 L CA 1.546 56.339 54.840 -0.078 0.000 0.752 31 L CB -0.833 41.247 42.059 0.035 0.000 0.896 31 L HN 0.302 nan 8.230 nan 0.000 0.433 32 Y N 1.000 121.001 120.300 -0.499 0.000 2.130 32 Y HA -0.199 4.409 4.550 0.096 0.000 0.287 32 Y C 2.529 178.200 175.900 -0.381 0.000 1.124 32 Y CA 1.891 59.468 58.100 -0.872 0.000 1.118 32 Y CB -0.340 37.444 38.460 -1.126 0.000 0.994 32 Y HN -0.001 nan 8.280 nan 0.000 0.497 33 V N -0.830 118.920 119.914 -0.273 0.000 2.809 33 V HA -0.057 4.125 4.120 0.103 0.000 0.256 33 V C 1.553 177.539 176.094 -0.181 0.000 1.080 33 V CA 1.506 63.661 62.300 -0.242 0.000 1.102 33 V CB -0.539 31.267 31.823 -0.030 0.000 0.705 33 V HN 0.263 nan 8.190 nan 0.000 0.475 34 R N 0.566 120.978 120.500 -0.147 0.000 2.334 34 R HA 0.248 4.650 4.340 0.103 0.000 0.220 34 R C 0.894 177.139 176.300 -0.092 0.000 0.917 34 R CA 0.475 56.535 56.100 -0.065 0.000 1.073 34 R CB -1.272 29.030 30.300 0.003 0.000 1.056 34 R HN 0.831 nan 8.270 nan 0.000 0.506 35 E N 0.347 120.443 120.200 -0.173 0.000 2.297 35 E HA -0.180 4.231 4.350 0.103 0.000 0.228 35 E C 0.144 176.693 176.600 -0.084 0.000 1.213 35 E CA 0.203 56.519 56.400 -0.140 0.000 0.712 35 E CB -0.873 28.745 29.700 -0.136 0.000 1.202 35 E HN 0.056 nan 8.360 nan 0.000 0.376 36 V N -0.052 119.822 119.914 -0.066 0.000 2.719 36 V HA -0.039 4.142 4.120 0.103 0.000 0.252 36 V C 0.714 176.559 176.094 -0.414 0.000 1.065 36 V CA 1.656 63.852 62.300 -0.172 0.000 1.086 36 V CB -0.332 31.413 31.823 -0.130 0.000 0.700 36 V HN 0.324 nan 8.190 nan 0.000 0.467 37 Y N -1.150 119.230 120.300 0.132 0.000 2.570 37 Y HA 0.572 5.224 4.550 0.170 0.000 0.345 37 Y C -2.385 173.647 175.900 0.220 0.000 1.014 37 Y CA -3.210 54.986 58.100 0.161 0.000 1.063 37 Y CB 0.934 39.484 38.460 0.151 0.000 1.272 37 Y HN -0.099 nan 8.280 nan 0.000 0.477 38 P HA -0.023 nan 4.420 nan 0.000 0.268 38 P C 0.921 178.436 177.300 0.358 0.000 1.205 38 P CA -0.007 63.224 63.100 0.218 0.000 0.771 38 P CB 0.761 32.547 31.700 0.143 0.000 0.858 39 V N 1.094 121.177 119.914 0.282 0.000 2.568 39 V HA -0.167 4.015 4.120 0.103 0.000 0.253 39 V C 2.168 178.505 176.094 0.404 0.000 1.072 39 V CA 2.159 64.699 62.300 0.401 0.000 1.084 39 V CB -2.110 29.846 31.823 0.222 0.000 0.676 39 V HN 0.627 nan 8.190 nan 0.000 0.469 40 G N 1.507 110.451 108.800 0.241 0.000 2.479 40 G HA2 -0.226 3.795 3.960 0.103 0.000 0.220 40 G HA3 -0.226 3.795 3.960 0.103 0.000 0.220 40 G C 1.461 176.437 174.900 0.126 0.000 1.115 40 G CA 1.245 46.441 45.100 0.160 0.000 0.757 40 G HN 0.870 nan 8.290 nan 0.000 0.560 41 I N -3.639 116.988 120.570 0.094 0.000 3.578 41 I HA 0.420 4.652 4.170 0.103 0.000 0.295 41 I C -0.104 175.885 176.117 -0.213 0.000 1.280 41 I CA -0.491 60.750 61.300 -0.098 0.000 1.347 41 I CB 0.054 37.914 38.000 -0.232 0.000 1.051 41 I HN -0.152 nan 8.210 nan 0.000 0.460 42 F N 1.654 121.661 119.950 0.094 0.000 2.422 42 F HA 0.562 5.165 4.527 0.127 0.000 0.333 42 F C 0.318 176.111 175.800 -0.013 0.000 1.095 42 F CA -0.476 57.551 58.000 0.045 0.000 1.038 42 F CB 1.328 40.355 39.000 0.045 0.000 1.156 42 F HN 0.010 nan 8.300 nan 0.000 0.483 43 Q N 2.997 122.874 119.800 0.129 0.000 2.353 43 Q HA 0.285 4.687 4.340 0.103 0.000 0.268 43 Q C -0.782 175.212 176.000 -0.010 0.000 1.045 43 Q CA -1.096 54.731 55.803 0.040 0.000 0.811 43 Q CB 1.824 30.569 28.738 0.012 0.000 1.305 43 Q HN 0.611 nan 8.270 nan 0.000 0.447 44 K N 2.924 123.303 120.400 -0.035 0.000 2.448 44 K HA 0.100 4.481 4.320 0.103 0.000 0.278 44 K C -0.635 175.940 176.600 -0.041 0.000 1.009 44 K CA 0.277 56.530 56.287 -0.057 0.000 0.995 44 K CB 0.503 32.978 32.500 -0.042 0.000 0.917 44 K HN 0.522 nan 8.250 nan 0.000 0.481 45 R N 2.617 123.089 120.500 -0.047 0.000 2.906 45 R HA 0.366 4.768 4.340 0.103 0.000 0.258 45 R C -1.137 175.144 176.300 -0.030 0.000 1.156 45 R CA -0.918 55.157 56.100 -0.041 0.000 0.996 45 R CB 1.245 31.512 30.300 -0.055 0.000 1.259 45 R HN 0.585 nan 8.270 nan 0.000 0.462 46 K N 1.663 122.044 120.400 -0.031 0.000 2.397 46 K HA 0.387 4.768 4.320 0.103 0.000 0.253 46 K C -1.180 175.401 176.600 -0.032 0.000 0.932 46 K CA -0.519 55.758 56.287 -0.015 0.000 0.795 46 K CB 1.182 33.674 32.500 -0.014 0.000 1.159 46 K HN 0.272 nan 8.250 nan 0.000 0.424 47 K N 3.441 123.843 120.400 0.004 0.000 2.501 47 K HA 0.186 4.567 4.320 0.103 0.000 0.252 47 K C -0.982 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0.397 nan 4.420 nan 0.000 0.271 51 P C -0.384 176.928 177.300 0.019 0.000 1.220 51 P CA 0.147 63.261 63.100 0.022 0.000 0.768 51 P CB 1.023 32.731 31.700 0.014 0.000 0.848 52 V N 0.728 120.637 119.914 -0.009 0.000 3.156 52 V HA 0.632 4.814 4.120 0.103 0.000 0.311 52 V C -1.184 174.841 176.094 -0.115 0.000 1.208 52 V CA -0.853 61.428 62.300 -0.032 0.000 1.063 52 V CB 2.303 34.134 31.823 0.014 0.000 1.098 52 V HN 0.217 nan 8.190 nan 0.000 0.452 53 Q N 1.614 121.308 119.800 -0.176 0.000 2.321 53 Q HA 0.623 5.025 4.340 0.103 0.000 0.270 53 Q C -1.489 174.543 176.000 0.053 0.000 1.032 53 Q CA -0.574 55.080 55.803 -0.249 0.000 0.784 53 Q CB 2.099 30.290 28.738 -0.911 0.000 1.264 53 Q HN 0.764 nan 8.270 nan 0.000 0.448 54 M N 1.181 120.872 119.600 0.153 0.000 2.321 54 M HA 0.283 4.824 4.480 0.103 0.000 0.315 54 M C 0.144 176.605 176.300 0.268 0.000 1.052 54 M CA -0.709 54.697 55.300 0.176 0.000 0.936 54 M CB 1.798 34.315 32.600 -0.138 0.000 1.639 54 M HN 0.528 nan 8.290 nan 0.000 0.433 55 S N 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nan 8.280 nan 0.000 0.526 70 C N -1.251 118.104 119.300 0.092 0.000 2.467 70 C HA 0.025 4.547 4.460 0.103 0.000 0.279 70 C C 2.796 177.696 174.990 -0.150 0.000 1.347 70 C CA 0.567 59.596 59.018 0.017 0.000 1.748 70 C CB -0.491 27.415 27.740 0.277 0.000 1.977 70 C HN 0.393 nan 8.230 nan 0.000 0.501 71 V N 0.993 120.858 119.914 -0.081 0.000 2.548 71 V HA -0.174 4.008 4.120 0.103 0.000 0.249 71 V C 2.516 178.547 176.094 -0.106 0.000 1.055 71 V CA 1.572 63.799 62.300 -0.122 0.000 1.065 71 V CB -0.622 31.193 31.823 -0.013 0.000 0.681 71 V HN 0.539 nan 8.190 nan 0.000 0.462 72 K N 0.399 120.741 120.400 -0.096 0.000 2.020 72 K HA -0.184 4.198 4.320 0.103 0.000 0.212 72 K C -0.155 176.382 176.600 -0.106 0.000 1.050 72 K CA 2.112 58.341 56.287 -0.096 0.000 0.929 72 K CB -1.095 31.326 32.500 -0.132 0.000 0.714 72 K HN 0.432 nan 8.250 nan 0.000 0.443 73 P HA -0.137 nan 4.420 nan 0.000 0.218 73 P C 1.350 178.595 177.300 -0.093 0.000 1.149 73 P CA 1.227 64.260 63.100 -0.112 0.000 0.817 73 P CB 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0.445 126 F N 0.097 120.086 119.950 0.065 0.000 2.134 126 F HA -0.141 4.448 4.527 0.102 0.000 0.299 126 F C 2.207 178.116 175.800 0.182 0.000 1.097 126 F CA 0.949 59.044 58.000 0.158 0.000 1.264 126 F CB -0.360 38.825 39.000 0.308 0.000 1.001 126 F HN 0.103 nan 8.300 nan 0.000 0.479 127 I N 0.026 120.830 120.570 0.390 0.000 2.163 127 I HA -0.294 3.937 4.170 0.103 0.000 0.243 127 I C 2.458 178.673 176.117 0.163 0.000 1.085 127 I CA 1.544 62.988 61.300 0.240 0.000 1.347 127 I CB -1.483 36.637 38.000 0.199 0.000 1.044 127 I HN 0.182 nan 8.210 nan 0.000 0.408 128 L N 0.114 121.419 121.223 0.136 0.000 2.042 128 L HA -0.220 4.181 4.340 0.103 0.000 0.210 128 L C 2.616 179.529 176.870 0.072 0.000 1.076 128 L CA 1.282 56.175 54.840 0.089 0.000 0.749 128 L CB -0.554 41.544 42.059 0.066 0.000 0.893 128 L HN 0.165 nan 8.230 nan 0.000 0.432 129 K N 0.135 120.574 120.400 0.065 0.000 2.097 129 K HA -0.040 4.342 4.320 0.103 0.000 0.205 129 K C 2.024 178.675 176.600 0.085 0.000 1.050 129 K CA 1.266 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-0.619 31.184 31.823 -0.033 0.000 0.904 136 V HN 0.217 nan 8.190 nan 0.000 0.435 137 L N 0.789 121.986 121.223 -0.045 0.000 2.330 137 L HA 0.666 5.067 4.340 0.103 0.000 0.271 137 L C -0.321 176.498 176.870 -0.086 0.000 1.013 137 L CA -0.698 54.112 54.840 -0.049 0.000 0.816 137 L CB 1.571 43.623 42.059 -0.011 0.000 1.287 137 L HN 0.026 nan 8.230 nan 0.000 0.435 138 D N -0.207 120.140 120.400 -0.088 0.000 2.358 138 D HA 0.134 4.835 4.640 0.103 0.000 0.244 138 D C 0.082 176.316 176.300 -0.110 0.000 1.163 138 D CA -0.201 53.714 54.000 -0.141 0.000 0.945 138 D CB 0.497 41.245 40.800 -0.087 0.000 1.152 138 D HN 0.262 nan 8.370 nan 0.000 0.451 139 H N 1.037 120.094 119.070 -0.022 0.000 3.016 139 H HA -0.002 4.616 4.556 0.102 0.000 0.345 139 H C 0.457 175.770 175.328 -0.025 0.000 1.066 139 H CA 0.400 56.432 56.048 -0.026 0.000 1.390 139 H CB 0.321 30.064 29.762 -0.032 0.000 1.344 139 H HN 0.195 nan 8.280 nan 0.000 0.605 140 N N 3.204 121.982 118.700 0.129 0.000 2.483 140 N HA 0.155 4.956 4.740 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1.300 144 C CA 0.776 59.765 59.018 -0.049 0.000 2.302 144 C CB 0.647 28.377 27.740 -0.018 0.000 2.655 144 C HN 0.959 nan 8.230 nan 0.000 0.656 145 T N -0.617 113.934 114.554 -0.004 0.000 2.693 145 T HA 0.864 5.275 4.350 0.103 0.000 0.278 145 T C -0.816 173.992 174.700 0.180 0.000 0.994 145 T CA -0.525 61.592 62.100 0.029 0.000 1.033 145 T CB 1.518 70.384 68.868 -0.005 0.000 1.342 145 T HN 0.854 nan 8.240 nan 0.000 0.538 146 F N -1.457 118.499 119.950 0.009 0.000 2.643 146 F HA 0.878 5.432 4.527 0.046 0.000 0.314 146 F C -0.715 175.133 175.800 0.080 0.000 1.096 146 F CA -0.838 57.202 58.000 0.066 0.000 0.953 146 F CB 1.685 40.742 39.000 0.095 0.000 1.345 146 F HN 0.907 nan 8.300 nan 0.000 0.468 147 T N 0.669 115.241 114.554 0.030 0.000 2.812 147 T HA 0.748 5.160 4.350 0.103 0.000 0.294 147 T C -2.076 172.760 174.700 0.227 0.000 1.159 147 T CA -0.520 61.538 62.100 -0.069 0.000 1.008 147 T CB 1.745 70.587 68.868 -0.045 0.000 1.289 147 T HN 0.709 nan 8.240 nan 0.000 0.514 148 V N 2.869 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